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NEBNext® Ultra™ II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒(含純化磁珠)
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文庫制備試劑盒 - 含片段化酶
NEBNext® Ultra™ II FS DNA PCR-free 文庫制備試劑盒 - 含片段化酶(含純化磁珠)
產(chǎn)品特點(diǎn)
·起始量范圍廣:250 ng 至 1,000 ng 的起始 DNA 均可制備高質(zhì)量文庫,且無需擴(kuò)增步驟
·更高的文庫產(chǎn)量,獲得更多有用信息
·提高文庫均一性,進(jìn)而提高測序質(zhì)量
·不同類型的起始樣本,均可制備 PCR-free 文庫
·通過優(yōu)化的 PCR-free 實(shí)驗(yàn)流程,減少手動(dòng)操作時(shí)間,并可與自動(dòng)化兼容
·配合使用 NEBNext 多樣本接頭引物試劑盒 1(Unique 雙端 Index 引物,UMI 接頭,適用于 DNA) (NEB #E7395)或其它具有3' T 突出的適用于 Illumina 平臺(tái)的接頭
·也可提供含有樣品純化磁珠的 NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文庫制備試劑盒(含純化磁珠)
產(chǎn)品概述
沒有偏差!基于簡化可靠的 Ultra II 流程,適用于 Illumina® 測序平臺(tái)的本試劑盒可為 DNA-seq 提供無需擴(kuò)增的文庫制備流程。即使 DNA 起始量低至 250 ng,也可獲得高質(zhì)量、高產(chǎn)量的文庫,而無需擔(dān)憂 PCR 偏差。
NEBNext Ultra II DNA PCR-Free 文庫制備試劑盒包含不同起始量、已打斷的 DNA 文庫制備所需的所有酶和緩沖液,以便在 Illumina 平臺(tái)上進(jìn)行二代測序,且不需要擴(kuò)增步驟??焖?、用戶友好的流程僅需最少的手動(dòng)操作時(shí)間,在無需 PCR 的情況下,就可獲得優(yōu)異的文庫產(chǎn)量和 GC 覆蓋度。
注意:如果您的起始 DNA 尚未打斷,我們推薦您使用 NEBNext Ultra II FS DNA PCR-Free 文庫制備試劑盒 - 含片段化酶,該試劑盒將 DNA 片段化、末端修復(fù)和加 dA 尾優(yōu)化到同一管中,無需純化或移液。
產(chǎn)品描述:
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒,能獲得更高的文庫產(chǎn)量。
A.以 1 µg NA19240 基因組 DNA(Coriell Institute)為起始樣本,使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒和 Illumina TruSeq® PCR-free 文庫制備試劑盒分別制備 PCR-free 文庫,350 bp 插入片段作為篩選標(biāo)準(zhǔn)。
B.分別使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒和 Roche Sequencing Kapa HyperPrep 文庫制備試劑盒,結(jié)合 Covaris 打斷,制備 150 - 200 bp 插入片段的文庫,不進(jìn)行片段篩選。根據(jù)生產(chǎn)商推薦方法,NEBNext、Illumina 和 Kapa 試劑盒分別使用了 NEBNext 多樣本接頭引物試劑盒 1(Unique 雙端 Index 引物,UMI 接頭,適用于 DNA)、IDT for Illumina(TruSeq DNA UD Indexes)和 Kapa Dual-Indexed Adaptors。
使用 NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒,實(shí)現(xiàn)人類基因組均一覆蓋。相較于 Illumina DNA PCR-free 文庫制備試劑盒,NEBNext Ultra II DNA PCR-free 文庫制備試劑盒可實(shí)現(xiàn)更高的基因組覆蓋度。根據(jù)生產(chǎn)商推薦方法,以 250 ng NA19240 基因組 DNA 為起始樣本制備文庫,使用 NovaSeq 6000 S4 v1.5 flow cell(PE 2 x 150 bp)測序。Reads 去接頭(fastp 0.20.0)后比對至端粒到端粒 chm13 參考基因組(draft 1,bwa-mem 0.7.17),并標(biāo)記重復(fù)(samblaster 0.1.24)。從每個(gè) bam 中隨機(jī)抽取 2.8 B Reads(sambamba view -s 0.6.8)。使用 mosdepth(v0.3.1,-F 772)評估過濾水平和初級(jí)覆蓋度,并繪制常染色體或線粒體基因組圖。圖中標(biāo)示出了預(yù)期覆蓋度(num_reads*read length/genome size)。