膜的水通量和脫鹽率是反滲透過程中關鍵的運行參數，這兩個參數將受到壓力、溫度、回收率、水的含鹽量、水的pH值因素的影響。
(1)壓力給水壓力升高使膜的水通量增大，壓力升高并不影響鹽透過量。在鹽透過量不變的情況下，水通量增大時，產品水含鹽量下降，脫鹽率提高。
(2)溫度溫度對反滲透的運行壓力、脫鹽率、壓降影響為明顯。溫度上升，滲透性能增加，在一定水通量下要求的凈推動力減少，因此實際運行壓力降低。同時溶質透過速率也隨溫度的升高而增加，鹽透過量增加，直接表現為產品水電導率升高。
(3)回收率回收率對各段壓降有很大的影響，在進水總流量保持一定和回收率增加的條件下，由于流經反滲透高壓側的濃水流量減少，總壓降降低；而回收率減少，則總壓降增大。
(4)進水含鹽量對同一系統(tǒng)來說，給水含鹽量不同，其運行壓力和產品水電導率也有差別，給水含鹽量每增加100ppm，進水壓力需增加約0.007MPa，同時由于濃度的增加，產品水電導率也相應增加。
(5)PH值各種膜組件都有一個允許的pH值范圍，即使在允許范圍內，PH值對產品水的電導率也有一定的影響。 這是因為反滲透膜本身大都帶有一些活性基團，pH值可以影響膜表面的電場進而影響到離子的遷移，另一方面pH值對進水中雜質的形態(tài)有直接影響，如對可離解的有機物，其截留率隨pH值的降低而下降。
(6)濃差極化工作壓力差越大，極化程度也越嚴重。超過濾出現嚴重極化時，膜面產生凝膠層，對溶劑流動產生附加阻力，并使?jié)B透速率的提高受到限制。反滲透出現嚴重極化時，則由于溶質濃度過高，會導致沉淀析出。
