羅氏熒光定量PCR儀LightCycler480詳細(xì)介紹
一、適用范圍:臨床/科研中利用熒光定量PCR方法檢測目標(biāo)基因,對其進(jìn)行定量或者定性分析或進(jìn)行基因分型或檢測突變,為臨床治療進(jìn)行指導(dǎo)。
二、熒光定量PCR儀LightCycler 480 II性能總結(jié)
作為熒光定量技術(shù)的持有者,羅氏公司一直致力于為客戶提供性能優(yōu)秀的定量產(chǎn)品,羅氏LightCycler® 480(以下簡稱LC-480)于2005年底面世,2006年開始在中國推廣,截至目前,已經(jīng)在中國各研究及醫(yī)療機(jī)構(gòu)銷售達(dá)1000多臺,市場反應(yīng)熱烈!
LC-480是在總結(jié)了目前市場上現(xiàn)有熒光定量的特點(diǎn)后,結(jié)合Roche自身的技術(shù)優(yōu)勢研發(fā)出來,在以下幾個方面體現(xiàn)了的技術(shù)特色:
1.反應(yīng)容器及檢測通量:
96孔,可選配升級為384孔反應(yīng)模塊。用戶可自行更換,無需工程師到場。
5色激發(fā)通道:290-800nm, 440,465,498,533,618nm; 6色熒光檢測通道: 488,510,588,610,640,660nm,適用多種熒光染料,開放性試劑,客戶可根據(jù)實(shí)際情況選擇ROCHE或其他廠家提供的試劑。
2.反應(yīng)體積:
96孔板: 10-100μl, 384孔板: 3-20μl,可節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本。
3.溫控系統(tǒng)(標(biāo)準(zhǔn)模式 ):
樣本升溫:4.8℃/秒,連續(xù)可調(diào)
均一性: +/-0.1℃(是板式定量PCR中溫度均一性好的產(chǎn)品)
準(zhǔn)確性: +/-0.1℃
反應(yīng)時間:不借助快速試劑,96孔<60min,384孔<40min
4.光學(xué)系統(tǒng):
4/1)采用白色固態(tài)光源,光強(qiáng)相對于氙燈更強(qiáng),波長范圍為全波長,適用多種熒光染料,開放性試劑,客戶可跟據(jù)實(shí)際情況選擇ROCHE或其他廠家提供的試劑。
4/2)激發(fā)光經(jīng)五角反射鏡減少光程差,消除光學(xué)邊緣效應(yīng)。
4/3)熱蓋的設(shè)計(jì)減少孔間光學(xué)信號交叉,鄰近孔之間大交叉干擾<0.02%。顏色補(bǔ)償軟件及濾光片減少同一孔內(nèi)的多種熒光染料的信號干擾,實(shí)現(xiàn)多重PCR方式。
5.線性范圍及檢測靈敏度:
定量動態(tài)范圍可達(dá)100-1010,樣品無需稀釋,達(dá)到單拷貝基因的水平。
6.精確性及重復(fù)性:
孔間檢測的重復(fù)性為CV≤0.15%。可以區(qū)分1000與2000拷貝的差異,而且此項(xiàng)會作為裝機(jī)指標(biāo)!
7.檢測模式:
熒光染料(SYBR Green等)、Taqman 探針、分子信標(biāo)、 Scorpion,雜交探針、單探針等
8.軟件系統(tǒng)革新:
8/1)*的大二階導(dǎo)數(shù)法取Ct值。
8/2)考慮PCR實(shí)際擴(kuò)增效率,而非武斷設(shè)定為2
8/3)含效率校正的相對定量軟件
8/4)高分辨率熔解曲線分析進(jìn)行基因掃描等
羅氏熒光定量PCR儀LightCycler480詳細(xì)介紹 特色功能:
1.HRM分析功能:
高分辨率熔解曲線 (High Resolution Melting, HRM)可以從更細(xì)致的程度研究雙鏈DNA的熱變性過程,從而獲取更多的信息量。HRM做為一種創(chuàng)新、均一、PCR擴(kuò)增反應(yīng)后進(jìn)行的分析方法,可應(yīng)用于對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中SNP,基因突變和甲基化等基因變異檢測等廣泛的研究分析領(lǐng)域,如對食品中病源微生物的快速篩查與檢測等。
憑借LightCycler® 480II系統(tǒng)*的基因掃描軟件和配套提供的高分辨率熔解曲線PCR反應(yīng)即用型體系HRM PCR Master,羅氏診斷應(yīng)用科學(xué)部提供了基于模塊式定量PCR儀上的整合式基因掃描方案。
2. Universal Probe Library通用探針庫(>5000000轉(zhuǎn)錄組)
只需要165個預(yù)制探針就完成上百萬種實(shí)時定量PCR實(shí)驗(yàn),對整個轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行高效研究。整套探針易于冰箱存儲,讓您的實(shí)時定量PCR檢測可靈活自在地進(jìn)行。
UPL的165個探針選自轉(zhuǎn)錄組中高頻率出現(xiàn)的8-和9-堿基序列,確??梢愿采w任意的一個轉(zhuǎn)錄組的全部轉(zhuǎn)錄子。
UPL探針僅8到9個核苷酸長,且含有Locked Nucleic Acids(LNA)。LNA是一類核糖2、4位羥基縮合形成氧橋的核酸類似物,這一特殊構(gòu)像的核糖能夠促進(jìn)堿基堆積及核糖預(yù)組織效應(yīng)從而提高其熱穩(wěn)定性,使僅不到10個核苷酸長度的探針Tm值有顯著的提高,方便進(jìn)行水解探針法的定量檢測。并且,含有LNA的UPL探針能夠辨別其他核酸探針無法區(qū)分的單堿基錯配,從而輕松保證您基因表達(dá)檢測的專一性要求。
3. RealTime ready 預(yù)制檢測板
這一系列的預(yù)制探針組合是用于多種qPCR檢測的即用預(yù)制微孔板,可直接用于檢測大量特定信號通路、代謝途徑或特定功能相關(guān)的基因表達(dá)情況。為方便使用,已預(yù)裝于LightCycler® 96-/384-孔板中,每一平板都含有目標(biāo)特異的引物以及Universal Probe Library探針。您所需添加的只有預(yù)混酶液、水以及樣本cDNA,就可以獲得類似于微流體芯片的分析功能,整個過程更加直觀、簡便。如果您有已知需要檢測的基因,羅氏還支持為您在線定制專屬的預(yù)制檢測板,大化地節(jié)省您寶貴的時間。
除了信號通路、代謝途徑或特定功能相關(guān)的目標(biāo)基因,每一預(yù)制平板上也包含了逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物特異的對照以及內(nèi)參基因用于簡化分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。