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森貝伽酵母DNA微量制備40ml與5ml各如何制備
一. 酵母DNA微量制備(40ml)
1. 在125ml三角瓶中用40ml YPD培養(yǎng)液在30℃條件下培養(yǎng)細(xì)胞達(dá)zui大生長量(過夜)。
2.將上述培養(yǎng)物移入螺蓋離心管,用*或Sorvall SS-34轉(zhuǎn)頭以5000r/min離心5分鐘,棄去上清液。
3.將細(xì)胞懸浮在3ml的0.9mol/L*-0.1mol/L Na2EDTA(pH7.5)溶液中。
4. 加0.1ml的2.5mg/ml消解酶100T,置37℃條件保溫1小時。
5. 用*或Sorvall SS-34轉(zhuǎn)頭以5000r/min離心5分鐘,棄去上清液。
6. 將細(xì)胞重新懸浮在5ml的50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)-20mmol/L醋酸鈉溶液中。
7.加0.5ml的10%十二烷基硫酸鈉(SDS),混勻。
8. 置65℃保溫30分鐘。
9.加1.5ml的5mol/L*溶液,在冰浴上放置1小時。
10. 用Sorvall SS-34轉(zhuǎn)頭以1000r/min離心10分鐘。
11.將上清液轉(zhuǎn)移至干凈的塑料離心管中,室溫下加入兩倍體積的95%乙醇,混勻,以5000~6000r/min離心15分鐘。
12. 棄上清液,將沉淀物干燥,然后懸浮在3ml TE緩沖液(pH7.4)中,此操作可能需要幾個小時。
13.用Sorvall SS-34轉(zhuǎn)頭以1000r/min離心15分鐘,將上清液轉(zhuǎn)移到一個新試管,棄沉淀物。
14.加入150μl的1mg/ml RNaseA溶液,在37℃下保溫30分鐘。
15.加入一倍體積的100%異丙醇,輕輕混勻,取出呈松散纖維狀的沉淀物,無需離心,讓其自然干燥。
16.將沉淀物懸浮在0.5ml TE緩沖液(pH7.4)中,置4℃保存。酵母DNA的zui終濃度約為200μg/ml。如果zui后的溶液混濁不清,用異丙醇再次沉淀DNA或用Sorvall SS-34轉(zhuǎn)頭以1000r/min離心15分鐘。
二. 酵母DNA微量制備(5ml)
1. 按酵母于5ml YPD中,置30℃培養(yǎng)過夜。
2.用*以2000r/min離心5分鐘沉淀細(xì)胞,棄上清液。
3. 將細(xì)胞懸浮在0.5ml的1mol/L*-0.1mol/L Na2EDTA(pH7.5)緩沖液中,轉(zhuǎn)動一支1.5ml離心管中。
4. 加入0.02ml的2.5mg/ml的消解酶100T溶液,置37℃保溫1小時。
5. 離心1小時。
6.棄上清液,把細(xì)胞懸浮在0.5ml的50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)-20mmol/L Na2EDTA溶液。
7. 加0.05ml的10% SDS,混勻。
8. 置65℃保溫混合物30分鐘。
9.加0.2ml的5mol/L*,把離心管在冰浴中放置1小時。
10. 離心5分鐘。
11. 將上清液轉(zhuǎn)移到一潔凈微型離心管,室溫下加入等體積的無水異丙醇,混勻,放置5分鐘。短暫離心(10秒鐘)棄上清液,讓沉淀自然干燥。
12. 用0.3ml TE緩沖液(pH7.4)重新懸浮沉淀。
13. 加入15μl的1mg/ml的RNaseA溶液,置37℃保溫30分鐘。
14. 加0.03ml的3mol/L醋酸鈉,混勻,用0.2ml的無水異丙醇沉淀,再短暫離心收集DNA。
15. 棄上清液,自然干燥,用0.1~0.3ml TE緩沖液(pH7.4)重新懸浮DNA。
16.在使用限制性內(nèi)切酶酶解DNA之前,有必要將zui終濃度溶液離心較長時間(15分鐘)以便除去可能抑制酶解的不溶性物質(zhì)。
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