HotStart Bst 4.2 Basic Mix(可凍干)

描述：

2.5xBst4.2 Basic Mix 包含了 Helicaser、dNTP、Mg2+、反應(yīng)緩沖鹽、凍干賦形劑和穩(wěn)定劑。HotStart Bst4.2DNA/RNA 聚合酶為單獨的組分。本品不僅可作為常規(guī)檢測試劑，對于具有凍干經(jīng)驗的研究者，
本品還直接進(jìn)行后續(xù)凍干，無需再加入任何其它輔料。

Bst4.2 具有以下性能：
（1）Bst 4.2 全系包含熱啟動Aptamer，該配體確保酶在<30℃時，酶活封閉效率>95%,在>60℃時 1min 內(nèi)釋放酶活。該特性利于室溫建立反應(yīng)體系，并大幅降低了低溫條件下的非特異擴(kuò)增；
（2）反應(yīng)溫度提升到 70℃，大幅降低引物 Dimer 的形成，提高擴(kuò)增特異性，并使得粗樣品核酸釋放更加充分；
（3）全系包含 Helicaser，因此，允許在不使用 F3/B3 引物的情況下進(jìn)行 LAMP 擴(kuò)增（easy LAMP），并允許 FIP/BIP 的引物用量降低一倍。這將進(jìn)一步降低非特異擴(kuò)增，并使得擴(kuò)增均一性大幅提升。本品為多用途的試劑，適用于 LAMP 進(jìn)行 MolecularBeacon 探針、DP-LAMP 探針、試紙條等檢測。
儲存：長期保存請置于-20℃以下（12 個月有效）；制品反復(fù)凍融10 次不影響性能，但應(yīng)避免反復(fù)凍融；制品由于含有高濃度的糖組分，-20℃保存的制品，在融化時可能會有結(jié)晶物。此時 2.5xBst4.2Mix 可在 37℃進(jìn)行融化，而 Bst4.2 酶制品在 30℃的溫度下融化，過高的溫度可能會導(dǎo)致熱啟動性能下降。一經(jīng)融化推薦置于2-8℃保存，在此條件下制品穩(wěn)定儲存 6 個月。
特殊說明：
（1） Bst4.2 DNA/RNA Polymerase 在用于 LAMP 擴(kuò)增時的推薦反應(yīng)溫度為 65-70℃，反應(yīng)溫度為 70℃。因此其可替代 的 Bst4.0 系列，用于標(biāo)準(zhǔn) LAMP 的擴(kuò)增。
（2） 由于 Helicaser 的反應(yīng)溫度為 70℃，因此在進(jìn)行 eLAMP 擴(kuò)增時，反應(yīng)溫度為 70℃。
（3） 制品中包含高濃度的鹽組分，使用時做好個人防護(hù)，防止制品與皮膚、眼、鼻、呼吸道等接觸和吸入，一旦接觸或吸入，請用大量的清水沖洗。
（4）防止氣溶膠污染，盡可能進(jìn)行分區(qū)操作。
1. 標(biāo)準(zhǔn) LAMP 和 eLAMP 擴(kuò)增的區(qū)別本試劑既可以用于標(biāo)準(zhǔn) LAMP 擴(kuò)增，也可以用于 eLAMP擴(kuò)增。
1.1 10x 標(biāo)準(zhǔn) LAMP Primer MixFIP/BIP=16 μM each; LF/LB=4 μM each; F3/B3=2 μM each
1.2 10xeLAMP Primer MixFIP/BIP=8 μM each; LF/LB=4 μM each
注意：eLAMP（easy LAMP）為去除 F3/B3 引物的方法，為 Bst4.2系列專用的使用策略，對于大多數(shù)引物組，在 Helicaser 的加持下，擴(kuò)增速度幾乎不受影響。如引物擴(kuò)增效率低，可提高 FIP/BIP 濃度到 12~16uM。
1.3 擴(kuò)增溫度不同標(biāo)準(zhǔn) LAMP 擴(kuò)增 eLAMP 擴(kuò)增65-70°C 均可 70°C 反應(yīng)
2. 配制 LAMP 反應(yīng)體系
2.5xBst4.2 Basic Mix 10 μl
10x Primer Mix 2.5 μl
HotStart Bst 4.2（8U/μl） 1 μl
模板 DNA/RNA X μl
ddH2O 到總體積 25 μl
反應(yīng)體系配好后，置于 65-70°C 反應(yīng) 20~30min。
3. 試劑的凍干反應(yīng)（僅限專業(yè)人員）本試劑可供具有凍干經(jīng)驗的人員直接進(jìn)行后續(xù)凍干，試劑的配方對凍干條件不苛刻。但對于不同的用戶來講，由于凍干形式、凍干體積、上機(jī)量、凍干容器、凍干磨具等因素存在差異，以下程序僅供參考。進(jìn)一步的程序優(yōu)化均需根據(jù)具體情況自行調(diào)整。對于非專業(yè)人員來講，請直接采購  的凍干制品，或委托訂制。
2.5xBst4.2 Basic Mix 10 μl
25xPrimer Mix 1 μl
HotStart Bst 4.2（8U/μl） 1 μl
Total 12 μl
制品成型后的凍干程序：
-50℃預(yù)凍 10min； -50℃ 4-8h（真空段）；-50℃升溫到 25℃（每小時升溫 5℃）；25℃ 2h； 25℃恒溫。

一、模板DNA：PCR反應(yīng)需要模板DNA，如從細(xì)胞、組織、血液中提取DNA等；

二、引物：PCR反應(yīng)的兩個引物，分別與模板DNA的兩端配對擴(kuò)增所需的特定區(qū)域，引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物；

三、dNTPs：PCR反應(yīng)中需要四種dNTPs，包括脫氧腺苷酸（dATP）、脫氧胸苷酸（dCTP）、脫氧鳥苷酸（dGTP）、脫氧胞嘧啶酸（dTTP），用于細(xì)胞分裂、DNA合成         等生物學(xué)過程，用于PCR擴(kuò)增的模板DNA鏈的延伸和擴(kuò)增；

四、Taq DNA聚合酶：PCR反應(yīng)需要的聚合酶，一般使用Taq聚合酶，還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等，用于擴(kuò)增DNA鏈；

五、PCR buffer溶液：對PCR反應(yīng)具有緩沖作用，調(diào)節(jié)反應(yīng)pH，硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機(jī)化合物如甲醛，可增強(qiáng)PCR反應(yīng)特異性，從而提高反應(yīng)效率；

六、酶切體系：PCR擴(kuò)增往往涉及到重組、構(gòu)建和測序等等實驗步驟，常常需要進(jìn)行酶切操作。

七、MARK:一種分子量標(biāo)準(zhǔn)，用來判別DNA片段大小的工具。

八、DNA純化試劑盒：用于純化PCR反應(yīng)產(chǎn)物；

①Oligo dT
選擇Oligo dT時，要求RNA必須有Poly A，所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT，對RNA樣品的質(zhì)量要求較高，不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進(jìn)行RT反應(yīng)，建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機(jī)引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。
②隨機(jī)引物
適合各種RNA的RT，尤其適合模板豐度很低的情況（比如某個gene表達(dá)量很低）。選擇隨機(jī)引物時，鏈cDNA合成反應(yīng)中就是以所有的RNA為模板，然后進(jìn)行PCR反應(yīng)時設(shè)計引物進(jìn)行特異性擴(kuò)增。同時要注意隨機(jī)引物的量和總RNA量之間的關(guān)系，一般建議每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量為50ng，如果每5µg總RNA的隨機(jī)引物的用量超過250ng，可能會導(dǎo)致小片段產(chǎn)物（＜500bp）的增加和長片段、全長產(chǎn)物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物（GSP）是某個基因序列的一部分，與模板互補(bǔ)的引物。該引物需要結(jié)合目標(biāo)RNA的已知序列進(jìn)行設(shè)計。由于引物和RNA序列特異性結(jié)合，每個目標(biāo)RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此，當(dāng)分析多種目標(biāo)時，則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同，所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物，建議對退火溫度進(jìn)行優(yōu)化。