ABI 3500基因測序儀的詳細介紹
Applied Biosystems公司的8道毛細管3500基因分析儀和24道毛細管3500xL基因分析儀為毛細管電泳建立了新的標準。3500系列基因分析儀為支持驗證和法規(guī)規(guī)范環(huán)境中對儀器性能的嚴格要求而設計,同時保留了生命科學研究人員心目中Applied Biosystems產(chǎn)品一貫擁有的*的應用多功能性.性能特點
- 8道毛細管3500系統(tǒng)和24道毛細管3500xL系統(tǒng),可升級。
- *的導熱系統(tǒng)設計,更好滿足DN段分析時對溫度控制的嚴格要求。
- 505 nm單波長固態(tài)長壽激光源——采用標準電源供電,無需散熱
- 不同儀器之間不同運行之間以及不同毛細管之間的信號強度一致性得到顯著改善
- 強大、綜合的數(shù)據(jù)采集和初步分析軟件,提供了數(shù)據(jù)質量的實時評估
- 無線射頻識別(RFID)技術追蹤關鍵消耗品數(shù)據(jù)并記錄管理信息
- *的多色熒光分析能力,可對DN段進行多達6種不同熒光染料的多重檢測
- *的應用靈活性—一種毛細管陣列、一種聚合物分離膠,通用于大部分研究應用
- 簡單的安裝、操作和維護——迄今為止最容易擁有、運行的DNA測序儀
3500系列可與你的工作環(huán)境無縫整合,確保了易用性,而又不失可靠性。提供即用型的上樣即可運行的消耗品,可縮短手工操作時間。預先配制好的基本消耗品避免了混合或操作誤差的可能性,在清空之后陽極和陰極緩沖液槽還可回收以循環(huán)再生。
高分子聚合物袋、陰極和陽極緩沖液槽、易于安裝的毛細管陣列都在產(chǎn)品標簽上包含了完整的無線電頻率識別(RFID)標簽。這些*的裝置能讓3500系列的數(shù)據(jù)采集軟件對試劑和消耗品的關鍵信息進行瀏覽、跟蹤和報告,其中包括用量、批號、貨號、保質期和儀器上的使用期限。在追蹤系統(tǒng)表現(xiàn)時,這些特征能幫助簡化關鍵的日常管理工作,省時省力。這個強有力的工具能將你的想法與實驗結果之間的屏障最小化。
簡單如同駕駛
3500 系列數(shù)據(jù)采集軟件的用戶友好導航采用直觀的儀表盤設計、顯而易見的常規(guī)操作按鈕、易讀取的圖表顯示。通過即時讀取堿基或片段大小的數(shù)據(jù),科學家們可以在數(shù)據(jù)產(chǎn)生時即判斷它們的質量,而無需將輸出文件轉移到二級分析軟件包。系統(tǒng)還提供了預配置的樣品反應板設置,來進一步支持快速有效的測序和片段分析的運行設置
DNA 測序
3500系列與Applied Biosystems BigDye® 循環(huán)測序試劑盒共同使用,更將超越預期,提供的自動化、性能表現(xiàn)、數(shù)據(jù)質量檢查以及簡易操作。3500系列可在最少的用戶干預下實現(xiàn)不同研究應用間的輕松轉換。此外,3500系列設計了特別方案,針對用BigDye xTerminator純化試劑盒所制備的樣品,可進一步提升序列質量。
片段分析
可同時檢測多達6 種熒光染料的設計,使得3500 系列可實現(xiàn)更高水平的多重片段分析應用,每輪運行中提供更高的通量水平和更多的數(shù)據(jù)點,同時也減低了每個樣品的平均費用。
將一切整合
3500平臺能運行多種類型的應用――包括新基因測序和重測序(突變圖譜)以及微衛(wèi)星分析、MLPA、LOH、AFLP、MLST,及SNP的驗證和篩選。大部分應用能在一種膠和毛細管陣列上運行,3500系列數(shù)據(jù)采集軟件可與多種Applied Biosystems下游軟件包無縫整合,從而提供了基因數(shù)據(jù)的綜合分析:
- Variant Reporter™軟件――用于突變檢測和分析,SNP探查和驗證,以及序列確認
- 測序分析軟件――用于測序數(shù)據(jù)的分析、顯示、編輯、保存和打印
- SeqScape軟件――用于突變檢測和基于樣品庫的等位基因鑒定
- GeneMapper軟件――基因分型、等位基因判定、片段分析和SNP分析的理想工具
Applied Biosystems 3500系列基因分析儀是我們全面完整的測序及片段分析應用系統(tǒng)中的組成部分,系統(tǒng)綜合了優(yōu)化的DNA分離試劑,包括特定的應用試劑盒和各種基因研究的工作流程,以及數(shù)據(jù)分析和瀏覽的工具。3500系列是目前大的基因分析工具。而且,8泳道毛細管的3500可相當容易地升級到24 泳道毛細管的3500xL,讓儀器伴隨你的實驗進展而擴展.
系統(tǒng)組件
- 毛細管電泳儀
- 8道毛細管(3500系統(tǒng))或24道毛細管(3500xL系統(tǒng))毛細管陣列及高分子分離膠
- DNA測序和/或片段分析系統(tǒng)專用的試劑及耗材
- Dell計算機工作站及液晶顯示器
- 整合的軟件,用于儀器控制、數(shù)據(jù)采集、質量控制,及用于堿基檢出和片段篩分的樣品文件自動分析
性能指標
性能 | |||||||
總體 | 90%樣品中等位基因的篩分精確度 | 90%樣品中等位基因的多道篩分 | |||||
90%以上樣品中的分辨率范圍 | 90%以上樣品中收集到的片斷 | 50–400bp | 401–600 bp | 601–1,200 bp | 50–400 bp | 401–600 bp | 601–1,200 bp |
≤40 to≥520 | ≥600 | <0.15 | <0.30 | NA | <1 bp | <2 bp | NA |
≤20 to≥550 | ≥600 | <0.15 | <0.30 | NA | <1 bp | <2 bp | NA |
≤40 to≥700 | ≥1200 | <0.15 | <0.30 | <0.45 | <1 bp | <2 bp | <3 bp |
≤60 to≥400 | ≥420 | <0.15 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
≤60 to≥400 | ≥420 | <0.15 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
≤40 to≥120 | ≥120 | <0.50 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
運行參數(shù)
激光 | 長壽命、單道505nm,固態(tài)激光激發(fā)源 |
電泳電壓 | 高達20 kV |
溫控箱溫度 | 動態(tài)溫度控制 從18°C到70°C |
計算機要求 | 硬件:奔騰IV 1.86 GHz處理器 操作系統(tǒng):Windows® Vista SP1 內存:2 GB 硬盤:1X 80 GB 7200 RPM SATA 3.0GB/s及 8 MB數(shù)據(jù)高速緩存 |
操作環(huán)境 | 溫度:15-30°C (在儀器運行時室溫的波動不能超過±2°C) 濕度:20-80%(不凝結) |
主要電源電壓 | 100-240 V±10% 50-60 Hz±10% |
電流 | 值:15 A |
功率消耗 | 417 VA、371 W(近似值,不包括計算機和顯示器) |
尺寸 | 寬度(門關閉):61 cm 寬度(門打開):122 cm 深度:61 cm 高度:72 cm 重量:82 kg(近似值) |