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生物通報(bào)道:來(lái)自第二軍醫(yī)大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室,東方肝膽醫(yī)院等處的研究人員利用Arraystar lncRNA芯片(長(zhǎng)鏈非編碼RNA芯片)對(duì)肝癌及癌旁組織進(jìn)行系統(tǒng)性篩查,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH在乙型肝炎病毒(HBV)導(dǎo)致的肝癌(HCC)發(fā)生中起重要作用,這一研究成果發(fā)表在Hepatology。
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領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是第二軍醫(yī)大學(xué)孫樹漢教授,孫樹漢教授現(xiàn)任第二軍醫(yī)大學(xué)遺傳學(xué)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科、基礎(chǔ)部醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室主任,全軍醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、遺傳研究所所長(zhǎng)等,主要研究方向是分子遺傳學(xué)研究,發(fā)表科研論文多篇,先后承擔(dān)了國(guó)家“973”、“863”、自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、面上項(xiàng)目等多個(gè)課題。這項(xiàng)研究就獲得了國(guó)家自然科學(xué)基金(81071680, 30671920),和傳染病重點(diǎn)項(xiàng)目(2008ZX10002-018, 2008ZX10002-025)的資助。
據(jù)報(bào)道,長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是一類本身不編碼蛋白、轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200nt的RNA分子,但是它可以在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)調(diào)控基因的表達(dá)。LncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來(lái)大量研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默,基因組印記以及染色質(zhì)修飾,轉(zhuǎn)錄激活,轉(zhuǎn)錄干擾,核內(nèi)運(yùn)輸?shù)榷喾N重要的生物學(xué)過(guò)程,并且在腫瘤發(fā)生過(guò)程中有重要的調(diào)控作用。
肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是目前我國(guó)致死率居第二位的惡性腫瘤,侵襲力強(qiáng),易轉(zhuǎn)移,預(yù)后差,五年預(yù)后存活率僅有10~20%。肝癌可由多種病因引起,乙肝病毒(hepatitis B Virus, HBV)感染是zui常見的潛在致病因子。因此,研究與發(fā)現(xiàn)新的肝癌特異的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)是改善乙肝病毒型肝癌的臨床治療效果的有效途徑。
在這篇文章中,孫樹漢教授課題組利用Arraystar公司的LncRNA芯片對(duì)相應(yīng)的肝癌和癌旁組織的LncRNA表達(dá)譜進(jìn)行了比較,找到了一個(gè)在癌組織中特異高表達(dá)的LncRNA(lncRNA-HEIH)。結(jié)合病人生存時(shí)間等臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH的表達(dá)水平可以作為病人生存時(shí)間的預(yù)測(cè)標(biāo)志,并且與癌癥的復(fù)發(fā)有較高的相關(guān)性。lncRNA-HEIH的功能研究提示它在細(xì)胞周期調(diào)控中起重要作用,它可能通過(guò)與EZH2結(jié)合來(lái)招募PRC2,進(jìn)而抑制下游靶基因的表達(dá)從而發(fā)揮其調(diào)控功能。這些結(jié)果表明lncRNA-HEIH有望成為病毒型肝癌的一個(gè)新的早期診斷標(biāo)志或治療靶點(diǎn)。
研究人員首先通過(guò)LncRNA芯片實(shí)驗(yàn)(LncRNA芯片實(shí)驗(yàn)在康成公司完成)和RT-PCR驗(yàn)證,在5例肝癌組織與5例癌旁組織樣本中找到了一個(gè)肝癌細(xì)胞高表達(dá)的LncRNA(lncRNA-HEIH),并且在大量樣本(50例肝癌和正常組織,20例肝硬化組織和正常肝組織)驗(yàn)證了lncRNA-HEIH的特異性。通過(guò)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖和病人生存時(shí)間等臨床數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH可以作為一個(gè)獨(dú)立的判斷HCC病人生存時(shí)間的預(yù)后指標(biāo)。一般lncRNA-HEIH表達(dá)越高,HCC病人的預(yù)后越差。
然后研究人員對(duì)lncRNA-HEIH的功能展開了深入的研究。他們利用過(guò)表達(dá)技術(shù)(gain of function )和RNAi技術(shù)(loss of fuction)發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH能促進(jìn)細(xì)胞增殖,在細(xì)胞周期調(diào)控過(guò)程中起重要作用。RNA免疫共沉淀和ChIP等實(shí)驗(yàn)揭示了lncRNA-HEIH可以通過(guò)結(jié)合EZH2招募PRC2,進(jìn)而抑制下游靶基因的表達(dá),實(shí)現(xiàn)調(diào)控細(xì)胞周期的功能。這些結(jié)果提示在肝細(xì)胞癌癥發(fā)生過(guò)程中,lncRNA-HEIH可能是一個(gè)重要的調(diào)控“樞紐”。
這篇文章的研究成果具有重要的生物學(xué)意義和臨床應(yīng)用價(jià)值:揭示了LncRNA在肝癌增殖過(guò)程中起重要的調(diào)控作用,并且通過(guò)功能實(shí)驗(yàn)找到了LncRNA調(diào)控細(xì)胞增殖的機(jī)制,為研究肝癌的發(fā)生機(jī)理提供了一些新的線索和研究思路;另外,LncRNA-HEIH的表達(dá)水平能夠很好的預(yù)測(cè)肝癌的預(yù)后情況,有可能作為一直新型分子標(biāo)記物用于肝癌的早期診斷。
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